Как следует из статистики народного образования Смоленской губернии, в селении Гнездово на станции Гнездово Риго-Орловской железной дороги в 1916 - 1917 учебном году начала работать начальная школа. В годы гражданской войны она была преобразована в неполную среднюю школу, школу крестьянской молодёжи (ШКМ). До Великой Отечественной войны школа располагалась в одноэтажном здании в районе "Белой станции" д. Гнездово. С 1929 по 1939 год школой руководил Гулейков Марк Алексеевич, в годы войны участвовавший в освобождении Смоленска и Гнездово. В 40-50 годы ХХ века школа располагалась в приспособленных помещениях.
В 1963 году школа переехала в новое здание в д.Новые Батеки, где и располагается по настоящее время.
В 1983 году восьмилетняя школа реорганизована в среднюю. Первый выпуск 10 класса был произведён в 1985 г.
В послевоенные годы директорами школы были: с 1946 по 1948 год - Голубева Екатерина Яковлевна, с 1948 по 1955 год Белков Петр Григорьевич, с 1955 по 1958 год Сергеев Алексей Константинович, с 1958 по 1959 год Рындин Виктор Иванович, с 1959 по 1971 год Горбатенко Алексей Семёнович, с 1972 по 2005 год Вознов Василий Сергеевич. С июля 2005 года Гнездовскую школу возглавлял Петров Михаил Николаевич. С 1 июля 2019 года во главе школы стоит Мужецкая Юлия Александровна.
На 01 сентября 2019 года в школе обучается 288 учащихся.
Педагогический коллектив объединяет 26 учителя. Трое - бывшие выпускники Гнездовской школы. Из 22 работающего учителя - 3 педагога пенсионного возраста, 3 учителя имеют высшую категорию, 18 педагогов - 1 категорию. Возрастной состав педагогов – оптимальный, средний возраст педагогических работников – 42 года.
